La Secretaría surge como una experiencia piloto en el año 1998 con el nombre de Departamento de Cooperación Internacional (DECI).

En sus orígenes tenía el objetivo de facilitar la asistencia judicial de los asuntos internacionales entre los tribunales de Mendoza y el mundo.

Paulatinamente fueron definiéndose sus alcances  al tiempo que fue afianzándose su labor.

En agosto de 1999 se la designa como autoridad central delegada para el cumplimiento de la Convención de Naciones Unidas sobre “Reconocimiento y ejecución en el extranjero de la obligación de prestar Alimentos”.

En noviembre de ese mismo año se consolida como organismo estable y en junio del 2001 amplía sus funciones al control y seguimiento de cartas rogatorias internacionales.

Desde el 2013 comienza a funcionar como Secretaría.

Actualmente, con más de 20 años de experiencia, se ha posicionado como referente en materia de cooperación internacional en el ámbito judicial del país y del mundo.